懷孕頭3個月胎兒首先發育的是頭尾部分及體節（骨骼肌肉和前身）；3O天發生感官和肢芽， 初步建立胚胎血液循環；60天肢芽伸長，顏面形成，心、肝、消化管和生殖器形成和發育。也就是說，頭3個月是胎兒重要器官形成的關鍵時期。在此期間藥物極易造成嬰兒先天缺陷。為此，在懷孕早期使用任何藥物都是危險的。

（l）應完全避免使用的藥物有：雄激素、雌激素、已烯雌酚、口服避孕藥、孕酮，這些藥物可使女胎兒男性化，男胎兒發育不良或死產、早產和腭裂等；促進蛋白合成藥物可有男性激素的致畸作用；秋水仙堿、環磷酰胺等可使染色體斷裂；四環素類藥物致骨及牙釉質發育不全；還有煙堿（包括吸煙）動物試驗有致畸作用。以上藥物應該完全避免使用。

（2）僅在孕婦必需時才能使用的藥物：苯丙胺類、抗癌藥物、口服抗凝藥、巴比妥酸鹽類、卡馬西平、氯霉素、氯喹、多粘菌素E、可的松類藥物、氟哌啶醇、卡那霉素、甲硝噠唑、萘啶酸、去甲阿密替林、苯妥因、撲癲酮、丙基硫氧嘧啶、奎尼丁、利血平、鏈霉素、噻嗪類利尿藥、氨砜噻噸、萬古霉素、紫霉素等。以上藥物對胎兒有潛在損害，除此則應避免。

（3）對胎兒可能產生損害的藥物：制酸藥、阿斯匹林、苯氧苯丙酸、速尿、慶大霉素、消炎痛、鐵、鋰、煙酰胺、口服降血糖藥、磺胺甲基異惡唑、弱安定類藥、甲氧芐氨嘧啶、大劑量維生素C和大劑量維生素D等。這些藥物應盡可能避免或減少使用。

另外，若當母體有病必須用藥時，可選用通常認為無致畸作用的老藥，由于對新藥致畸性尚未充分了解，一般應避免使用。