支原體最突出的結構特征是沒有細胞壁。一般來講， 它對作用于細胞壁的生物合成抗菌素，如β－內酰胺類、萬古霉素等完全不敏感，對多粘菌素、利福平、磺胺藥物普遍耐藥。對支原體最有抑制活性及常用于支原體感染的抗菌素是四環素類、大環內酯類及一些喹諾酮類藥物，氨基糖苷類、氯霉素類等其他類抗菌素對支原體有較小的抑制作用，所以不常用來作為治療支原體感染的藥物。

　　患者在確診為尿路支原體感染后，可應用以下藥物治療：

　　一、四環素類

　　1.四環素:每次500毫克，每日4次，共用14天。四環素對解脲支原體和人型支原體均可達到滿意的效果，若用藥14天后仍分離有支原體，可再給予第2個療程的治療。四環素最好在空腹時服用，以便吸收良好，但不可同時飲牛奶或奶制品，也不要與抗酸藥物和含鐵、鎂、鈣、鋁等多價金屬的藥物同時服用。副作用為惡心、嘔吐等消化道反應，少數可引起腸炎。同時，所有四環素類藥物均可引起光敏性皮炎。因此類藥物可使出生的兒童發生四環素牙(黃染牙齒)及影響嬰兒骨骼正常發育，故孕婦、哺乳期婦女禁用。

　　2.強力霉素(多西環素、去氧土霉素):每次200毫克，每日2次，共用14天，口服。此藥受食物和金屬離子的影響較小，消化道反應也較輕。禁用于孕婦及哺乳期婦女。

　　3.美滿霉素(米諾環素、甲胺四環素):每次100毫克，每日2次，共用14天，首劑量加倍。副作用有頭暈、眼花、運動失調、可逆性前庭反應及惡心嘔吐、食欲下降等消化道反應，尤其是服藥的頭幾天較多見。（禁忌癥同四環素）

　　二、大環內酯類

　　1.紅霉素:每次500毫克。每日4次，共14日，口服。對解脲支原體效果好，而對人型支原體無效。空腹服藥和大量飲水有助吸收，但胃腸道副作用較大。臨床上，紅霉素是治療非淋菌性尿道炎的一線藥物，尤其可作為孕婦、哺乳期婦女首選藥物，對解脲支原體性尿道炎較四環素更顯優勢。

　　2.交沙霉素(角沙霉素):每次400毫克，每日4次，共用14日，口服。抗菌譜和抗菌活性與紅霉素相近，胃腸副作用較紅霉素輕。孕婦頭3個月禁用。

　　3.利菌沙(琥乙紅霉素):每次500毫克，每日4 次，共用14日，口服。孕婦和哺乳期婦女慎用。

　　4.羅紅霉素(肟西紅霉素):每次150毫克，每日2次，共用14日，口服。臨床療效尚待評價，孕婦和哺乳期婦女慎用。

　　5.克拉霉素(甲紅霉素、克紅霉素):每次500～1000毫克，每日2次，共用14日，口服。孕婦和哺乳期婦女禁用。

　　6.阿齊霉素(阿齊紅霉素):每次500～1000毫克，每日1次，連用3日，口服。孕婦和哺乳期婦女慎用。

　　三、喹諾酮類

　　1.氧氟沙星（氟嗪酸、泰利必妥）:每次200毫克，每日2次，共用14日，口服。常見不良反應為皮疹、胃腸道副作用。孕婦、哺乳期婦女、幼兒以及對本品過敏者慎用。

　　2.環丙沙星（悉復歡）:每次250毫克，每日2次，共用14日，口服。不良反應禁忌癥同氧氟沙星。

　　3.司帕沙星（司氟沙星）:每次200毫克，每日2次，共用14日，口服。常見不良反應為噯氣、腹瀉、頭痛、頭暈。禁忌癥同氧氟沙星。

　　上述三類藥物并非特效藥，有時要結合臨床上是否合并其他性病而選擇適宜藥物為準則。有些藥物如慶大霉素、新霉素、青霉素、大觀霉素等對支原體感染亦有效。

　　另外，我國傳統醫藥對支原體所致非淋菌性尿道炎有獨特的治療。根據辨證施治，非淋菌性尿道炎分為以下兩種：1.下焦濕熱型：清熱利濕、解毒化濁；2.脾腎虧虛型：健脾補腎、利濕化濁，常用四君子湯和六味地黃丸加減。

　　男性尿道支原體感染，其性伴偶被感染檢出率最高可達36.8％，因此必須同時檢查治療，方能避免再感染。判斷治愈的標準是：1.臨床癥狀消失一周以上，尿道無分泌物或分泌物中白細胞≤4個／100倍顯微鏡下；2.尿液澄清，沉渣檢呈陰性；3.尿道或宮頸標本支原體檢查呈陰性。