抗菌藥不一定比別的藥副作用大，但是其使用機會多和使用人群廣，因此，存在些許副作用也可影響許多患者。其中，抗菌藥對肝功能影響就是需要注意的問題。特別是已有肝功能障礙患者應慎重使用。

　　青霉素類：天然型青霉素比合成型青霉素(如阿莫西林、氨芐西林、哌拉西林等)引起肝功能障礙少見。青霉素引起肝功能障礙主要表現用藥后出現發熱、皮膚發紅等過敏現象。出現此種情況應立即檢查肝功。如有異常，立即改用其他抗菌藥。有報阿莫西林/克拉維酸鉀合劑可引起重癥肝功能障礙而導致死亡。

　　頭孢菌素：通過變態反應引起肝功能障礙。臨床并不多見，輕度反應可出現短時轉氨酶升高。但迄今已有因使用頭孢唑林、頭孢替安和頭孢美唑引起需要住院治療的肝功能障礙的患者。有報道，頭孢曲松可引起嚴重肝功能障礙。

　　四環素類：靜脈注射超過1.5克，相當一部分患者可出現肝功能障礙，特別是腎功能障礙患者更為危險。少量長期口服四環素可引起肝功能障礙，并有持續黃膽，多發生在用藥5周以內。用藥1年以上有引起自身免疫性肝炎的危險。另外，據世界衛生組織報道，因使用米諾環素可有6%的人出現肝功能障礙，多發生在用藥后3周到數月。