對已感染結核菌的人群，投予抗結核藥物，以防止發生結核病，就是藥物預防；但健康人無須服抗結核藥物進行預防，而且即使服了也無效。

目前藥物預防使用的主要藥品為異煙肼，其效果好，副作用少，價格便宜，使用方便。劑量成人為每天0.3~0.4克，頓服，兒童按每公斤體重5~10毫克給藥（總量不超過300毫克），頓服。

療程為：

①每日連服藥共1年（超過1年并不能取得更好的效果）。

②服藥3個月，停藥3個月，再服藥3個月，停藥3個月，如此共2年。③每日服異煙肼6個月。目前以服異煙肼6或12個月的方案最為常用。

下列人群可考慮應用藥物預防，依次是：

①家庭內與新發現傳染源有密切接觸的結素試驗陽性（特別是強陽性）少年兒童。

②結素試驗陽性、X線提示有非活動性病變，且以前沒有經抗結核藥物治療者。

③新感染病例，特別是5歲以1下嬰幼兒或青春期結素試驗呈強陽性反應者。

④結素試驗陽性，處于結核高度好發的范疇內。如：長期服用皮質激素或其它免疫抑制劑治療者；白血病或膠原病患者；糖尿病或矽肺患者；胃切除術后等。

⑤某些職業35歲以下結素試驗直徑在15毫米以上陽性人群。如：新入伍士兵，接觸結核病人的青年醫務工作者等。不過，藥物預防也有禁忌者，凡有精神病、肝炎、異煙肼中毒史者、孕婦、嗜酒者為禁忌癥。

此外，用異煙肼藥物預防也會出現一些副作用，多見于用藥頭2~3個月內，在此期間要加強隨訪，以了解藥物預防的效果。